Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NfiaQ02780 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NfiaQ02780 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NfiaQ02780 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NfiaQ02780 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NfiaQ02780 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NfiaQ02780 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NfiaQ02780 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NfiaQ02780 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NfiaQ02780 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NfiaQ02780 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NfiaQ02780 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NfiaQ02780 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
NfiaQ02780 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NfiaQ02780 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NfiaQ02780 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NfiaQ02780 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NfiaQ02780 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NfiaQ02780 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NfiaQ02780 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NfiaQ02780 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NfiaQ02780 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NfiaQ02780 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NfiaQ02780 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NfiaQ02780 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NfiaQ02780 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NfiaQ02780 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NfiaQ02780 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NfiaQ02780 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NfiaQ02780 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NfiaQ02780 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NfiaQ02780 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NfiaQ02780 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NfiaQ02780 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NfiaQ02780 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NfiaQ02780 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NfiaQ02780 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NfiaQ02780 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NfiaQ02780 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NfiaQ02780 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NfiaQ02780 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NfiaQ02780 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NfiaQ02780 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NfiaQ02780 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NfiaQ02780 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NfiaQ02780 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NfiaQ02780 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NfiaQ02780 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NfiaQ02780 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NfiaQ02780 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NfiaQ02780 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NfiaQ02780 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NfiaQ02780 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NfiaQ02780 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NfiaQ02780 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NfiaQ02780 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NfiaQ02780 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NfiaQ02780 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NfiaQ02780 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NfiaQ02780 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NfiaQ02780 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NfiaQ02780 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NfiaQ02780 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NfiaQ02780 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NfiaQ02780 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NfiaQ02780 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NfiaQ02780 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NfiaQ02780 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NfiaQ02780 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NfiaQ02780 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NfiaQ02780 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NfiaQ02780 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NfiaQ02780 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NfiaQ02780 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NfiaQ02780 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NfiaQ02780 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NfiaQ02780 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NfiaQ02780 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NfiaQ02780 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NfiaQ02780 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NfiaQ02780 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NfiaQ02780 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NfiaQ02780 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NfiaQ02780 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NfiaQ02780 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NfiaQ02780 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NfiaQ02780 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NfiaQ02780 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NfiaQ02780 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NfiaQ02780 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NfiaQ02780 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NfiaQ02780 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NfiaQ02780 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms