Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ank1Q02357 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ank1Q02357 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ank1Q02357 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ank1Q02357 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ank1Q02357 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ank1Q02357 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ank1Q02357 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ank1Q02357 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ank1Q02357 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Ank1Q02357 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ank1Q02357 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ank1Q02357 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ank1Q02357 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ank1Q02357 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ank1Q02357 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ank1Q02357 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ank1Q02357 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ank1Q02357 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ank1Q02357 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ank1Q02357 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ank1Q02357 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ank1Q02357 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ank1Q02357 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ank1Q02357 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ank1Q02357 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ank1Q02357 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ank1Q02357 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ank1Q02357 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ank1Q02357 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ank1Q02357 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ank1Q02357 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ank1Q02357 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ank1Q02357 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ank1Q02357 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ank1Q02357 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ank1Q02357 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ank1Q02357 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ank1Q02357 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ank1Q02357 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ank1Q02357 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ank1Q02357 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ank1Q02357 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Ank1Q02357 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ank1Q02357 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ank1Q02357 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ank1Q02357 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ank1Q02357 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ank1Q02357 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ank1Q02357 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ank1Q02357 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ank1Q02357 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Ank1Q02357 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ank1Q02357 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ank1Q02357 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ank1Q02357 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ank1Q02357 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ank1Q02357 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ank1Q02357 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ank1Q02357 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ank1Q02357 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ank1Q02357 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ank1Q02357 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ank1Q02357 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ank1Q02357 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ank1Q02357 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ank1Q02357 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ank1Q02357 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ank1Q02357 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ank1Q02357 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ank1Q02357 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ank1Q02357 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ank1Q02357 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ank1Q02357 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ank1Q02357 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ank1Q02357 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ank1Q02357 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ank1Q02357 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ank1Q02357 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ank1Q02357 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ank1Q02357 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ank1Q02357 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Ank1Q02357 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ank1Q02357 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ank1Q02357 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ank1Q02357 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ank1Q02357 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ank1Q02357 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ank1Q02357 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ank1Q02357 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ank1Q02357 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ank1Q02357 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ank1Q02357 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ank1Q02357 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms