Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ank1Q02357 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ank1Q02357 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Ank1Q02357 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Ank1Q02357 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Ank1Q02357 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Ank1Q02357 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Ank1Q02357 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Ank1Q02357 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ank1Q02357 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3,19
Ank1Q02357 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Ank1Q02357 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Ank1Q02357 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Ank1Q02357 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Ank1Q02357 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Ank1Q02357 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Ank1Q02357 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Ank1Q02357 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Ank1Q02357 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Ank1Q02357 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Ank1Q02357 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Ank1Q02357 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Ank1Q02357 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Ank1Q02357 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Ank1Q02357 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Ank1Q02357 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Ank1Q02357 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Ank1Q02357 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Ank1Q02357 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Ank1Q02357 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ank1Q02357 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Ank1Q02357 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Ank1Q02357 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Ank1Q02357 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ank1Q02357 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ank1Q02357 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Ank1Q02357 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Ank1Q02357 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Ank1Q02357 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ank1Q02357 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Ank1Q02357 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Ank1Q02357 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,25■■■■□ 3,07
Ank1Q02357 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Ank1Q02357 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Ank1Q02357 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ank1Q02357 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Ank1Q02357 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Ank1Q02357 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Ank1Q02357 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ank1Q02357 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ank1Q02357 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ank1Q02357 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Ank1Q02357 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Ank1Q02357 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ank1Q02357 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ank1Q02357 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Ank1Q02357 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ank1Q02357 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ank1Q02357 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
Ank1Q02357 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ank1Q02357 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ank1Q02357 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ank1Q02357 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Ank1Q02357 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Ank1Q02357 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ank1Q02357 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ank1Q02357 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ank1Q02357 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ank1Q02357 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ank1Q02357 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ank1Q02357 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Ank1Q02357 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Ank1Q02357 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Ank1Q02357 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ank1Q02357 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Ank1Q02357 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Ank1Q02357 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ank1Q02357 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Ank1Q02357 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Ank1Q02357 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ank1Q02357 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Ank1Q02357 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Ank1Q02357 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ank1Q02357 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Ank1Q02357 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Ank1Q02357 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Ank1Q02357 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Ank1Q02357 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ank1Q02357 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Ank1Q02357 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Ank1Q02357 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Ank1Q02357 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Ank1Q02357 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Ank1Q02357 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,9 ms