Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gbp1Q01514 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Gbp1Q01514 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gbp1Q01514 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Gbp1Q01514 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Gbp1Q01514 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Gbp1Q01514 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Gbp1Q01514 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gbp1Q01514 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Gbp1Q01514 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Gbp1Q01514 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Gbp1Q01514 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Gbp1Q01514 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Gbp1Q01514 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Gbp1Q01514 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gbp1Q01514 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Gbp1Q01514 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Gbp1Q01514 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gbp1Q01514 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gbp1Q01514 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Gbp1Q01514 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Gbp1Q01514 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Gbp1Q01514 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Gbp1Q01514 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Gbp1Q01514 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gbp1Q01514 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gbp1Q01514 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Gbp1Q01514 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Gbp1Q01514 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Gbp1Q01514 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gbp1Q01514 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gbp1Q01514 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gbp1Q01514 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gbp1Q01514 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Gbp1Q01514 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gbp1Q01514 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Gbp1Q01514 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gbp1Q01514 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gbp1Q01514 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Gbp1Q01514 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gbp1Q01514 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gbp1Q01514 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Gbp1Q01514 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gbp1Q01514 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gbp1Q01514 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gbp1Q01514 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gbp1Q01514 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gbp1Q01514 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gbp1Q01514 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gbp1Q01514 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gbp1Q01514 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gbp1Q01514 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gbp1Q01514 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gbp1Q01514 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gbp1Q01514 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gbp1Q01514 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gbp1Q01514 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Gbp1Q01514 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gbp1Q01514 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gbp1Q01514 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Gbp1Q01514 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gbp1Q01514 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gbp1Q01514 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gbp1Q01514 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gbp1Q01514 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gbp1Q01514 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Gbp1Q01514 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gbp1Q01514 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Gbp1Q01514 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gbp1Q01514 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gbp1Q01514 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gbp1Q01514 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,2
Gbp1Q01514 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Gbp1Q01514 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Gbp1Q01514 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gbp1Q01514 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gbp1Q01514 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gbp1Q01514 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Gbp1Q01514 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gbp1Q01514 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,3 ms