Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pde4dQ01063 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pde4dQ01063 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Pde4dQ01063 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pde4dQ01063 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Pde4dQ01063 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pde4dQ01063 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pde4dQ01063 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pde4dQ01063 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pde4dQ01063 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pde4dQ01063 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pde4dQ01063 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pde4dQ01063 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pde4dQ01063 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pde4dQ01063 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pde4dQ01063 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pde4dQ01063 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pde4dQ01063 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pde4dQ01063 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pde4dQ01063 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pde4dQ01063 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Pde4dQ01063 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pde4dQ01063 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pde4dQ01063 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Pde4dQ01063 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pde4dQ01063 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pde4dQ01063 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pde4dQ01063 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pde4dQ01063 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pde4dQ01063 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pde4dQ01063 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pde4dQ01063 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pde4dQ01063 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Pde4dQ01063 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pde4dQ01063 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pde4dQ01063 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms