Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gjb2Q00977 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gjb2Q00977 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gjb2Q00977 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gjb2Q00977 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gjb2Q00977 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gjb2Q00977 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gjb2Q00977 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gjb2Q00977 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gjb2Q00977 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gjb2Q00977 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gjb2Q00977 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gjb2Q00977 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gjb2Q00977 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Gjb2Q00977 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gjb2Q00977 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gjb2Q00977 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Gjb2Q00977 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gjb2Q00977 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gjb2Q00977 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gjb2Q00977 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gjb2Q00977 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gjb2Q00977 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gjb2Q00977 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gjb2Q00977 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gjb2Q00977 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gjb2Q00977 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gjb2Q00977 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gjb2Q00977 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gjb2Q00977 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gjb2Q00977 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gjb2Q00977 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gjb2Q00977 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Gjb2Q00977 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gjb2Q00977 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gjb2Q00977 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gjb2Q00977 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gjb2Q00977 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gjb2Q00977 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gjb2Q00977 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gjb2Q00977 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Gjb2Q00977 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gjb2Q00977 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gjb2Q00977 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gjb2Q00977 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gjb2Q00977 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gjb2Q00977 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gjb2Q00977 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gjb2Q00977 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gjb2Q00977 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gjb2Q00977 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gjb2Q00977 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gjb2Q00977 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gjb2Q00977 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gjb2Q00977 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gjb2Q00977 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gjb2Q00977 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Gjb2Q00977 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gjb2Q00977 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gjb2Q00977 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gjb2Q00977 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gjb2Q00977 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gjb2Q00977 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gjb2Q00977 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gjb2Q00977 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gjb2Q00977 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gjb2Q00977 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gjb2Q00977 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Gjb2Q00977 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gjb2Q00977 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gjb2Q00977 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gjb2Q00977 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gjb2Q00977 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gjb2Q00977 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gjb2Q00977 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Gjb2Q00977 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gjb2Q00977 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gjb2Q00977 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gjb2Q00977 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gjb2Q00977 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gjb2Q00977 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Gjb2Q00977 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gjb2Q00977 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Gjb2Q00977 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gjb2Q00977 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gjb2Q00977 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Gjb2Q00977 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gjb2Q00977 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gjb2Q00977 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gjb2Q00977 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gjb2Q00977 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gjb2Q00977 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Gjb2Q00977 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gjb2Q00977 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gjb2Q00977 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gjb2Q00977 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gjb2Q00977 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gjb2Q00977 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Gjb2Q00977 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gjb2Q00977 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms