Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx4P70452 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx4P70452 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx4P70452 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx4P70452 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx4P70452 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx4P70452 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx4P70452 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx4P70452 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx4P70452 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx4P70452 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx4P70452 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx4P70452 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx4P70452 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx4P70452 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx4P70452 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx4P70452 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx4P70452 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx4P70452 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx4P70452 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx4P70452 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx4P70452 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx4P70452 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx4P70452 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx4P70452 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx4P70452 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx4P70452 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx4P70452 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx4P70452 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx4P70452 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx4P70452 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx4P70452 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx4P70452 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx4P70452 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx4P70452 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx4P70452 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx4P70452 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx4P70452 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx4P70452 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx4P70452 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx4P70452 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx4P70452 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx4P70452 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx4P70452 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx4P70452 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx4P70452 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx4P70452 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx4P70452 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx4P70452 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx4P70452 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx4P70452 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx4P70452 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx4P70452 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx4P70452 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx4P70452 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx4P70452 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx4P70452 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx4P70452 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx4P70452 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx4P70452 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx4P70452 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx4P70452 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx4P70452 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx4P70452 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms