Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ext2P70428 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ext2P70428 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ext2P70428 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ext2P70428 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ext2P70428 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ext2P70428 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ext2P70428 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ext2P70428 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ext2P70428 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ext2P70428 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ext2P70428 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ext2P70428 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ext2P70428 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ext2P70428 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ext2P70428 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ext2P70428 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ext2P70428 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ext2P70428 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ext2P70428 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ext2P70428 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ext2P70428 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ext2P70428 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ext2P70428 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ext2P70428 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ext2P70428 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ext2P70428 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ext2P70428 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ext2P70428 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ext2P70428 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ext2P70428 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ext2P70428 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ext2P70428 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ext2P70428 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ext2P70428 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ext2P70428 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ext2P70428 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ext2P70428 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ext2P70428 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ext2P70428 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ext2P70428 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ext2P70428 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ext2P70428 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ext2P70428 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ext2P70428 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ext2P70428 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ext2P70428 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ext2P70428 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ext2P70428 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ext2P70428 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ext2P70428 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ext2P70428 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ext2P70428 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ext2P70428 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ext2P70428 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ext2P70428 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ext2P70428 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ext2P70428 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ext2P70428 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ext2P70428 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ext2P70428 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ext2P70428 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ext2P70428 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ext2P70428 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ext2P70428 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ext2P70428 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ext2P70428 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ext2P70428 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ext2P70428 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ext2P70428 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ext2P70428 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ext2P70428 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ext2P70428 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ext2P70428 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ext2P70428 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ext2P70428 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ext2P70428 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ext2P70428 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ext2P70428 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ext2P70428 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ext2P70428 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ext2P70428 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ext2P70428 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ext2P70428 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ext2P70428 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ext2P70428 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ext2P70428 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ext2P70428 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms