Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Plxna1P70206 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Plxna1P70206 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
Plxna1P70206 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Plxna1P70206 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Plxna1P70206 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Plxna1P70206 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Plxna1P70206 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Plxna1P70206 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Plxna1P70206 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Plxna1P70206 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Plxna1P70206 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Plxna1P70206 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Plxna1P70206 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Plxna1P70206 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Plxna1P70206 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Plxna1P70206 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Plxna1P70206 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Plxna1P70206 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Plxna1P70206 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Plxna1P70206 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Plxna1P70206 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Plxna1P70206 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Plxna1P70206 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Plxna1P70206 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Plxna1P70206 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Plxna1P70206 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Plxna1P70206 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Plxna1P70206 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Plxna1P70206 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Plxna1P70206 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Plxna1P70206 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Plxna1P70206 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Plxna1P70206 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Plxna1P70206 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Plxna1P70206 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Plxna1P70206 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Plxna1P70206 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Plxna1P70206 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Plxna1P70206 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Plxna1P70206 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Plxna1P70206 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Plxna1P70206 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Plxna1P70206 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Plxna1P70206 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Plxna1P70206 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Plxna1P70206 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Plxna1P70206 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Plxna1P70206 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Plxna1P70206 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Plxna1P70206 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Plxna1P70206 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Plxna1P70206 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Plxna1P70206 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Plxna1P70206 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Plxna1P70206 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Plxna1P70206 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Plxna1P70206 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Plxna1P70206 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Plxna1P70206 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Plxna1P70206 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Plxna1P70206 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Plxna1P70206 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Plxna1P70206 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Plxna1P70206 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Plxna1P70206 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Plxna1P70206 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Plxna1P70206 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Plxna1P70206 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Plxna1P70206 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Plxna1P70206 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Plxna1P70206 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Plxna1P70206 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Plxna1P70206 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Plxna1P70206 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Plxna1P70206 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Plxna1P70206 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Plxna1P70206 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Plxna1P70206 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Plxna1P70206 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms