Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacng7P62956 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng7P62956 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng7P62956 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng7P62956 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacng7P62956 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacng7P62956 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacng7P62956 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng7P62956 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng7P62956 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacng7P62956 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacng7P62956 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng7P62956 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng7P62956 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng7P62956 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng7P62956 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng7P62956 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacng7P62956 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacng7P62956 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacng7P62956 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacng7P62956 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacng7P62956 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacng7P62956 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacng7P62956 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacng7P62956 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacng7P62956 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacng7P62956 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacng7P62956 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacng7P62956 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacng7P62956 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cacng7P62956 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cacng7P62956 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cacng7P62956 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cacng7P62956 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cacng7P62956 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacng7P62956 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacng7P62956 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacng7P62956 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacng7P62956 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacng7P62956 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacng7P62956 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacng7P62956 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacng7P62956 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacng7P62956 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacng7P62956 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacng7P62956 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacng7P62956 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacng7P62956 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacng7P62956 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacng7P62956 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cacng7P62956 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cacng7P62956 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacng7P62956 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacng7P62956 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms