Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Megf8P60882 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Megf8P60882 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Megf8P60882 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Megf8P60882 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Megf8P60882 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Megf8P60882 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Megf8P60882 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Megf8P60882 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Megf8P60882 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Megf8P60882 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Megf8P60882 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Megf8P60882 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Megf8P60882 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Megf8P60882 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Megf8P60882 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Megf8P60882 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Megf8P60882 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Megf8P60882 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Megf8P60882 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Megf8P60882 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Megf8P60882 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Megf8P60882 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Megf8P60882 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Megf8P60882 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Megf8P60882 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Megf8P60882 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Megf8P60882 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Megf8P60882 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Megf8P60882 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Megf8P60882 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Megf8P60882 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Megf8P60882 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Megf8P60882 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Megf8P60882 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Megf8P60882 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Megf8P60882 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Megf8P60882 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Megf8P60882 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Megf8P60882 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Megf8P60882 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Megf8P60882 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Megf8P60882 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Megf8P60882 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Megf8P60882 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Megf8P60882 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Megf8P60882 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Megf8P60882 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Megf8P60882 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Megf8P60882 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Megf8P60882 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Megf8P60882 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Megf8P60882 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Megf8P60882 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Megf8P60882 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Megf8P60882 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Megf8P60882 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Megf8P60882 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Megf8P60882 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Megf8P60882 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Megf8P60882 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Megf8P60882 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Megf8P60882 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Megf8P60882 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Megf8P60882 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Megf8P60882 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Megf8P60882 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Megf8P60882 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Megf8P60882 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Megf8P60882 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Megf8P60882 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Megf8P60882 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms