Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrn4P59383 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrn4P59383 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrn4P59383 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrn4P59383 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrn4P59383 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrn4P59383 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrn4P59383 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrn4P59383 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrn4P59383 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrn4P59383 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrn4P59383 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrn4P59383 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrn4P59383 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrn4P59383 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrn4P59383 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrn4P59383 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrn4P59383 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrn4P59383 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrn4P59383 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn4P59383 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn4P59383 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrn4P59383 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrn4P59383 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms