Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl8P59280 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl8P59280 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl8P59280 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl8P59280 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl8P59280 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl8P59280 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl8P59280 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl8P59280 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl8P59280 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl8P59280 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl8P59280 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl8P59280 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl8P59280 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl8P59280 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl8P59280 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl8P59280 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl8P59280 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl8P59280 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl8P59280 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl8P59280 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl8P59280 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl8P59280 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl8P59280 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl8P59280 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl8P59280 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl8P59280 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl8P59280 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl8P59280 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl8P59280 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl8P59280 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl8P59280 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl8P59280 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl8P59280 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl8P59280 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl8P59280 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl8P59280 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl8P59280 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl8P59280 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl8P59280 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl8P59280 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl8P59280 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl8P59280 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl8P59280 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klhl8P59280 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl8P59280 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl8P59280 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl8P59280 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl8P59280 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms