Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Nphp4P59240 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Nphp4P59240 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Nphp4P59240 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Nphp4P59240 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Nphp4P59240 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Nphp4P59240 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Nphp4P59240 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Nphp4P59240 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Nphp4P59240 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Nphp4P59240 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Nphp4P59240 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Nphp4P59240 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Nphp4P59240 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Nphp4P59240 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nphp4P59240 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Nphp4P59240 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Nphp4P59240 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Nphp4P59240 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Nphp4P59240 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Nphp4P59240 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Nphp4P59240 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Nphp4P59240 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Nphp4P59240 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Nphp4P59240 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Nphp4P59240 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Nphp4P59240 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Nphp4P59240 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Nphp4P59240 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Nphp4P59240 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Nphp4P59240 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Nphp4P59240 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Nphp4P59240 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nphp4P59240 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Nphp4P59240 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Nphp4P59240 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Nphp4P59240 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Nphp4P59240 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Nphp4P59240 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nphp4P59240 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nphp4P59240 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Nphp4P59240 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Nphp4P59240 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Nphp4P59240 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Nphp4P59240 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Nphp4P59240 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Nphp4P59240 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Nphp4P59240 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Nphp4P59240 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Nphp4P59240 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Nphp4P59240 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Nphp4P59240 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Nphp4P59240 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Nphp4P59240 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Nphp4P59240 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Nphp4P59240 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Nphp4P59240 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Nphp4P59240 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nphp4P59240 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Nphp4P59240 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Nphp4P59240 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Nphp4P59240 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Nphp4P59240 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Nphp4P59240 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Nphp4P59240 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Nphp4P59240 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Nphp4P59240 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nphp4P59240 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Nphp4P59240 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Nphp4P59240 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Nphp4P59240 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Nphp4P59240 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Nphp4P59240 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Nphp4P59240 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Nphp4P59240 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Nphp4P59240 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Nphp4P59240 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Nphp4P59240 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nphp4P59240 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Nphp4P59240 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nphp4P59240 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Nphp4P59240 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Nphp4P59240 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Nphp4P59240 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Nphp4P59240 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Nphp4P59240 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Nphp4P59240 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Nphp4P59240 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms