Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Strn4P58404 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Strn4P58404 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Strn4P58404 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Strn4P58404 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Strn4P58404 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Strn4P58404 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Strn4P58404 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Strn4P58404 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Strn4P58404 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Strn4P58404 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Strn4P58404 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Strn4P58404 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Strn4P58404 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Strn4P58404 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Strn4P58404 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Strn4P58404 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Strn4P58404 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Strn4P58404 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Strn4P58404 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Strn4P58404 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Strn4P58404 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Strn4P58404 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Strn4P58404 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Strn4P58404 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Strn4P58404 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Strn4P58404 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Strn4P58404 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Strn4P58404 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Strn4P58404 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Strn4P58404 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Strn4P58404 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Strn4P58404 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Strn4P58404 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Strn4P58404 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Strn4P58404 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Strn4P58404 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Strn4P58404 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Strn4P58404 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Strn4P58404 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Strn4P58404 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Strn4P58404 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Strn4P58404 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Strn4P58404 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Strn4P58404 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Strn4P58404 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Strn4P58404 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Strn4P58404 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Strn4P58404 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Strn4P58404 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Strn4P58404 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Strn4P58404 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Strn4P58404 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Strn4P58404 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Strn4P58404 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Strn4P58404 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Strn4P58404 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Strn4P58404 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Strn4P58404 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Strn4P58404 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Strn4P58404 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Strn4P58404 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Strn4P58404 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Strn4P58404 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Strn4P58404 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Strn4P58404 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Strn4P58404 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Strn4P58404 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Strn4P58404 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Strn4P58404 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Strn4P58404 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Strn4P58404 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Strn4P58404 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Strn4P58404 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Strn4P58404 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Strn4P58404 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Strn4P58404 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Strn4P58404 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Strn4P58404 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Strn4P58404 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Strn4P58404 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Strn4P58404 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Strn4P58404 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Strn4P58404 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Strn4P58404 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Strn4P58404 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Strn4P58404 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Strn4P58404 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Strn4P58404 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Strn4P58404 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Strn4P58404 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Strn4P58404 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Strn4P58404 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Strn4P58404 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms