Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gsc2P56916 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gsc2P56916 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gsc2P56916 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gsc2P56916 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gsc2P56916 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsc2P56916 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gsc2P56916 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gsc2P56916 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gsc2P56916 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gsc2P56916 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gsc2P56916 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gsc2P56916 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gsc2P56916 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gsc2P56916 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsc2P56916 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsc2P56916 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsc2P56916 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsc2P56916 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsc2P56916 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsc2P56916 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsc2P56916 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gsc2P56916 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsc2P56916 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gsc2P56916 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsc2P56916 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gsc2P56916 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsc2P56916 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsc2P56916 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsc2P56916 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gsc2P56916 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gsc2P56916 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gsc2P56916 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gsc2P56916 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gsc2P56916 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gsc2P56916 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gsc2P56916 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gsc2P56916 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gsc2P56916 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gsc2P56916 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gsc2P56916 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gsc2P56916 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gsc2P56916 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gsc2P56916 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gsc2P56916 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gsc2P56916 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gsc2P56916 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsc2P56916 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsc2P56916 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsc2P56916 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsc2P56916 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsc2P56916 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gsc2P56916 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gsc2P56916 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms