Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpc4P51655 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpc4P51655 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc4P51655 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc4P51655 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc4P51655 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gpc4P51655 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gpc4P51655 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpc4P51655 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpc4P51655 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpc4P51655 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpc4P51655 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpc4P51655 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpc4P51655 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gpc4P51655 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpc4P51655 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gpc4P51655 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gpc4P51655 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc4P51655 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc4P51655 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc4P51655 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gpc4P51655 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc4P51655 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpc4P51655 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpc4P51655 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpc4P51655 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gpc4P51655 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpc4P51655 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpc4P51655 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gpc4P51655 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpc4P51655 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc4P51655 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc4P51655 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc4P51655 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc4P51655 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpc4P51655 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc4P51655 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpc4P51655 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpc4P51655 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpc4P51655 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpc4P51655 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc4P51655 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpc4P51655 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpc4P51655 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc4P51655 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc4P51655 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc4P51655 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpc4P51655 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpc4P51655 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc4P51655 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc4P51655 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc4P51655 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc4P51655 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc4P51655 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc4P51655 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc4P51655 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc4P51655 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc4P51655 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc4P51655 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc4P51655 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc4P51655 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms