Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Defa8P50706 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Defa8P50706 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Defa8P50706 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Defa8P50706 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Defa8P50706 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Defa8P50706 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Defa8P50706 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Defa8P50706 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Defa8P50706 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Defa8P50706 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Defa8P50706 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Defa8P50706 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Defa8P50706 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Defa8P50706 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Defa8P50706 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Defa8P50706 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Defa8P50706 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Defa8P50706 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Defa8P50706 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Defa8P50706 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa8P50706 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Defa8P50706 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Defa8P50706 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Defa8P50706 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Defa8P50706 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Defa8P50706 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Defa8P50706 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Defa8P50706 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Defa8P50706 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Defa8P50706 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Defa8P50706 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Defa8P50706 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Defa8P50706 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Defa8P50706 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Defa8P50706 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Defa8P50706 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Defa8P50706 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Defa8P50706 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Defa8P50706 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Defa8P50706 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Defa8P50706 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Defa8P50706 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Defa8P50706 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Defa8P50706 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Defa8P50706 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Defa8P50706 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa8P50706 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa8P50706 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa8P50706 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Defa8P50706 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Defa8P50706 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Defa8P50706 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Defa8P50706 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa8P50706 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa8P50706 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Defa8P50706 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defa8P50706 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defa8P50706 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Defa8P50706 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa8P50706 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa8P50706 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defa8P50706 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defa8P50706 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Defa8P50706 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa8P50706 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa8P50706 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa8P50706 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa8P50706 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defa8P50706 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defa8P50706 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defa8P50706 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa8P50706 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa8P50706 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms