Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtpreP49446 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtpreP49446 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtpreP49446 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtpreP49446 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtpreP49446 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtpreP49446 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtpreP49446 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtpreP49446 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtpreP49446 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtpreP49446 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtpreP49446 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtpreP49446 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtpreP49446 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtpreP49446 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtpreP49446 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtpreP49446 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PtpreP49446 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtpreP49446 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtpreP49446 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtpreP49446 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtpreP49446 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PtpreP49446 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PtpreP49446 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtpreP49446 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtpreP49446 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtpreP49446 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PtpreP49446 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtpreP49446 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtpreP49446 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PtpreP49446 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PtpreP49446 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtpreP49446 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtpreP49446 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtpreP49446 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtpreP49446 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtpreP49446 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtpreP49446 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtpreP49446 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PtpreP49446 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpreP49446 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpreP49446 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtpreP49446 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtpreP49446 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpreP49446 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpreP49446 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtpreP49446 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtpreP49446 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtpreP49446 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtpreP49446 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtpreP49446 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtpreP49446 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PtpreP49446 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtpreP49446 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpreP49446 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpreP49446 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpreP49446 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtpreP49446 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtpreP49446 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtpreP49446 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PtpreP49446 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtpreP49446 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpreP49446 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtpreP49446 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtpreP49446 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpreP49446 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpreP49446 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtpreP49446 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtpreP49446 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PtpreP49446 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtpreP49446 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtpreP49446 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtpreP49446 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtpreP49446 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpreP49446 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtpreP49446 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtpreP49446 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtpreP49446 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PtpreP49446 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtpreP49446 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtpreP49446 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtpreP49446 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtpreP49446 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtpreP49446 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtpreP49446 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PtpreP49446 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PtpreP49446 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtpreP49446 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PtpreP49446 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtpreP49446 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpreP49446 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpreP49446 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
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