Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Myo1bP46735 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Myo1bP46735 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Myo1bP46735 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Myo1bP46735 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Myo1bP46735 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Myo1bP46735 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Myo1bP46735 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Myo1bP46735 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Myo1bP46735 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Myo1bP46735 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Myo1bP46735 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Myo1bP46735 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Myo1bP46735 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Myo1bP46735 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Myo1bP46735 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Myo1bP46735 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Myo1bP46735 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Myo1bP46735 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Myo1bP46735 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Myo1bP46735 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Myo1bP46735 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Myo1bP46735 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Myo1bP46735 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Myo1bP46735 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Myo1bP46735 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo1bP46735 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Myo1bP46735 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo1bP46735 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo1bP46735 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Myo1bP46735 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo1bP46735 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo1bP46735 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo1bP46735 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Myo1bP46735 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Myo1bP46735 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Myo1bP46735 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Myo1bP46735 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Myo1bP46735 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Myo1bP46735 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Myo1bP46735 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Myo1bP46735 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo1bP46735 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Myo1bP46735 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Myo1bP46735 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo1bP46735 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Myo1bP46735 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Myo1bP46735 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Myo1bP46735 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Myo1bP46735 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Myo1bP46735 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Myo1bP46735 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Myo1bP46735 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Myo1bP46735 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Myo1bP46735 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo1bP46735 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo1bP46735 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Myo1bP46735 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo1bP46735 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo1bP46735 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Myo1bP46735 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo1bP46735 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo1bP46735 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo1bP46735 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Myo1bP46735 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Myo1bP46735 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Myo1bP46735 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Myo1bP46735 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Myo1bP46735 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Myo1bP46735 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Myo1bP46735 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Myo1bP46735 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Myo1bP46735 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Myo1bP46735 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Myo1bP46735 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myo1bP46735 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myo1bP46735 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myo1bP46735 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Myo1bP46735 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Myo1bP46735 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Myo1bP46735 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo1bP46735 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo1bP46735 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo1bP46735 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Myo1bP46735 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Myo1bP46735 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo1bP46735 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo1bP46735 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms