Protein–RNA interactions for Protein: P32114

Pax2, Paired box protein Pax-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax2P32114 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax2P32114 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax2P32114 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax2P32114 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax2P32114 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax2P32114 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax2P32114 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax2P32114 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax2P32114 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax2P32114 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax2P32114 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax2P32114 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pax2P32114 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax2P32114 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax2P32114 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax2P32114 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax2P32114 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax2P32114 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pax2P32114 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pax2P32114 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pax2P32114 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax2P32114 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pax2P32114 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pax2P32114 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pax2P32114 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pax2P32114 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pax2P32114 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pax2P32114 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax2P32114 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax2P32114 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax2P32114 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pax2P32114 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pax2P32114 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax2P32114 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax2P32114 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax2P32114 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax2P32114 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax2P32114 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax2P32114 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pax2P32114 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pax2P32114 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax2P32114 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax2P32114 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax2P32114 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax2P32114 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pax2P32114 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pax2P32114 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pax2P32114 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pax2P32114 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pax2P32114 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pax2P32114 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax2P32114 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax2P32114 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax2P32114 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax2P32114 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pax2P32114 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms