Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ca8P28651 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ca8P28651 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ca8P28651 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ca8P28651 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ca8P28651 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ca8P28651 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ca8P28651 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Ca8P28651 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ca8P28651 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ca8P28651 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ca8P28651 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Ca8P28651 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Ca8P28651 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ca8P28651 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Ca8P28651 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ca8P28651 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ca8P28651 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ca8P28651 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ca8P28651 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ca8P28651 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ca8P28651 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ca8P28651 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ca8P28651 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ca8P28651 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ca8P28651 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ca8P28651 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ca8P28651 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ca8P28651 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ca8P28651 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ca8P28651 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ca8P28651 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ca8P28651 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ca8P28651 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ca8P28651 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ca8P28651 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ca8P28651 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ca8P28651 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Ca8P28651 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Ca8P28651 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ca8P28651 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ca8P28651 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ca8P28651 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Ca8P28651 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ca8P28651 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ca8P28651 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ca8P28651 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ca8P28651 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ca8P28651 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ca8P28651 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ca8P28651 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ca8P28651 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ca8P28651 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ca8P28651 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ca8P28651 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ca8P28651 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ca8P28651 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ca8P28651 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ca8P28651 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Ca8P28651 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ca8P28651 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ca8P28651 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ca8P28651 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ca8P28651 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ca8P28651 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ca8P28651 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ca8P28651 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ca8P28651 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ca8P28651 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Ca8P28651 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ca8P28651 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ca8P28651 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Ca8P28651 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ca8P28651 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ca8P28651 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ca8P28651 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ca8P28651 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Ca8P28651 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ca8P28651 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ca8P28651 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ca8P28651 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ca8P28651 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ca8P28651 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ca8P28651 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ca8P28651 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ca8P28651 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ca8P28651 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ca8P28651 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ca8P28651 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ca8P28651 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Ca8P28651 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ca8P28651 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Ca8P28651 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ca8P28651 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms