Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Col2a1P28481 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col2a1P28481 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col2a1P28481 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Col2a1P28481 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col2a1P28481 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Col2a1P28481 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col2a1P28481 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Col2a1P28481 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Col2a1P28481 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col2a1P28481 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col2a1P28481 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col2a1P28481 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Col2a1P28481 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Col2a1P28481 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Col2a1P28481 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Col2a1P28481 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Col2a1P28481 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col2a1P28481 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Col2a1P28481 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col2a1P28481 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col2a1P28481 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Col2a1P28481 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Col2a1P28481 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Col2a1P28481 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Col2a1P28481 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Col2a1P28481 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Col2a1P28481 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col2a1P28481 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col2a1P28481 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Col2a1P28481 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col2a1P28481 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col2a1P28481 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col2a1P28481 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Col2a1P28481 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Col2a1P28481 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Col2a1P28481 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Col2a1P28481 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Col2a1P28481 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Col2a1P28481 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Col2a1P28481 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Col2a1P28481 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Col2a1P28481 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Col2a1P28481 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Col2a1P28481 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Col2a1P28481 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Col2a1P28481 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Col2a1P28481 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Col2a1P28481 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Col2a1P28481 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Col2a1P28481 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Col2a1P28481 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Col2a1P28481 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Col2a1P28481 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Col2a1P28481 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Col2a1P28481 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Col2a1P28481 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Col2a1P28481 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Col2a1P28481 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Col2a1P28481 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Col2a1P28481 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Col2a1P28481 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Col2a1P28481 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Col2a1P28481 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Col2a1P28481 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Col2a1P28481 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Col2a1P28481 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Col2a1P28481 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Col2a1P28481 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Col2a1P28481 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Col2a1P28481 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Col2a1P28481 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Col2a1P28481 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Col2a1P28481 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col2a1P28481 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col2a1P28481 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col2a1P28481 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col2a1P28481 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col2a1P28481 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms