Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmb9P28076 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmb9P28076 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmb9P28076 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmb9P28076 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmb9P28076 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmb9P28076 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmb9P28076 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmb9P28076 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmb9P28076 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmb9P28076 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmb9P28076 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmb9P28076 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmb9P28076 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmb9P28076 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmb9P28076 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmb9P28076 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmb9P28076 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmb9P28076 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmb9P28076 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmb9P28076 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmb9P28076 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmb9P28076 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmb9P28076 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmb9P28076 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmb9P28076 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmb9P28076 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmb9P28076 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmb9P28076 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmb9P28076 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmb9P28076 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmb9P28076 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmb9P28076 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmb9P28076 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmb9P28076 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmb9P28076 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmb9P28076 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmb9P28076 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb9P28076 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb9P28076 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb9P28076 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmb9P28076 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmb9P28076 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmb9P28076 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmb9P28076 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmb9P28076 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb9P28076 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmb9P28076 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmb9P28076 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmb9P28076 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmb9P28076 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmb9P28076 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmb9P28076 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmb9P28076 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmb9P28076 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms