Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Pax3P24610 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Pax3P24610 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Pax3P24610 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Pax3P24610 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Pax3P24610 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Pax3P24610 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Pax3P24610 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Pax3P24610 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Pax3P24610 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Pax3P24610 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Pax3P24610 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Pax3P24610 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Pax3P24610 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Pax3P24610 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Pax3P24610 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Pax3P24610 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Pax3P24610 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Pax3P24610 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Pax3P24610 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Pax3P24610 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Pax3P24610 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pax3P24610 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Pax3P24610 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pax3P24610 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Pax3P24610 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Pax3P24610 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pax3P24610 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pax3P24610 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Pax3P24610 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Pax3P24610 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Pax3P24610 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pax3P24610 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pax3P24610 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pax3P24610 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pax3P24610 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Pax3P24610 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Pax3P24610 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pax3P24610 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Pax3P24610 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Pax3P24610 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Pax3P24610 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Pax3P24610 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pax3P24610 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pax3P24610 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pax3P24610 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Pax3P24610 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Pax3P24610 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Pax3P24610 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Pax3P24610 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Pax3P24610 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Pax3P24610 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Pax3P24610 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Pax3P24610 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Pax3P24610 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Pax3P24610 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pax3P24610 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pax3P24610 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Pax3P24610 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Pax3P24610 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Pax3P24610 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pax3P24610 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pax3P24610 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pax3P24610 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Pax3P24610 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Pax3P24610 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Pax3P24610 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Pax3P24610 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Pax3P24610 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pax3P24610 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pax3P24610 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Pax3P24610 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Pax3P24610 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Pax3P24610 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Pax3P24610 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Pax3P24610 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Pax3P24610 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Pax3P24610 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pax3P24610 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pax3P24610 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pax3P24610 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pax3P24610 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pax3P24610 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pax3P24610 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Pax3P24610 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Pax3P24610 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pax3P24610 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Pax3P24610 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pax3P24610 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pax3P24610 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pax3P24610 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pax3P24610 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms