Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ntf3P20181 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ntf3P20181 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Ntf3P20181 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ntf3P20181 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
Ntf3P20181 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ntf3P20181 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ntf3P20181 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ntf3P20181 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ntf3P20181 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ntf3P20181 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ntf3P20181 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ntf3P20181 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ntf3P20181 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ntf3P20181 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ntf3P20181 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Ntf3P20181 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ntf3P20181 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ntf3P20181 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ntf3P20181 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ntf3P20181 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ntf3P20181 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ntf3P20181 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ntf3P20181 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ntf3P20181 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ntf3P20181 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ntf3P20181 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ntf3P20181 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ntf3P20181 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ntf3P20181 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,39■■□□□ 1,34
Ntf3P20181 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ntf3P20181 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ntf3P20181 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ntf3P20181 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ntf3P20181 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ntf3P20181 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ntf3P20181 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ntf3P20181 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
Ntf3P20181 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ntf3P20181 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ntf3P20181 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,2■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ntf3P20181 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ntf3P20181 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Ntf3P20181 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ntf3P20181 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ntf3P20181 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ntf3P20181 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ntf3P20181 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ntf3P20181 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ntf3P20181 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ntf3P20181 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ntf3P20181 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ntf3P20181 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ntf3P20181 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ntf3P20181 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ntf3P20181 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms