Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ntf3P20181 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ntf3P20181 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ntf3P20181 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ntf3P20181 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ntf3P20181 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ntf3P20181 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ntf3P20181 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ntf3P20181 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ntf3P20181 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ntf3P20181 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ntf3P20181 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ntf3P20181 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ntf3P20181 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ntf3P20181 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ntf3P20181 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ntf3P20181 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ntf3P20181 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ntf3P20181 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ntf3P20181 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ntf3P20181 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ntf3P20181 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ntf3P20181 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ntf3P20181 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ntf3P20181 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ntf3P20181 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ntf3P20181 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ntf3P20181 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ntf3P20181 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ntf3P20181 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ntf3P20181 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ntf3P20181 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntf3P20181 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntf3P20181 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntf3P20181 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ntf3P20181 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ntf3P20181 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ntf3P20181 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ntf3P20181 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ntf3P20181 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ntf3P20181 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ntf3P20181 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntf3P20181 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ntf3P20181 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ntf3P20181 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ntf3P20181 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntf3P20181 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntf3P20181 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ntf3P20181 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntf3P20181 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ntf3P20181 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ntf3P20181 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ntf3P20181 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntf3P20181 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntf3P20181 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntf3P20181 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms