Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csn1s1P19228 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csn1s1P19228 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csn1s1P19228 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csn1s1P19228 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csn1s1P19228 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csn1s1P19228 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csn1s1P19228 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csn1s1P19228 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csn1s1P19228 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csn1s1P19228 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Csn1s1P19228 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csn1s1P19228 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csn1s1P19228 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csn1s1P19228 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csn1s1P19228 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csn1s1P19228 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csn1s1P19228 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csn1s1P19228 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csn1s1P19228 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Csn1s1P19228 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csn1s1P19228 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csn1s1P19228 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csn1s1P19228 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Csn1s1P19228 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csn1s1P19228 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Csn1s1P19228 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Csn1s1P19228 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csn1s1P19228 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csn1s1P19228 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csn1s1P19228 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csn1s1P19228 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csn1s1P19228 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csn1s1P19228 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csn1s1P19228 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csn1s1P19228 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Csn1s1P19228 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csn1s1P19228 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csn1s1P19228 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csn1s1P19228 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csn1s1P19228 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csn1s1P19228 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Csn1s1P19228 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csn1s1P19228 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csn1s1P19228 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csn1s1P19228 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csn1s1P19228 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csn1s1P19228 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Csn1s1P19228 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csn1s1P19228 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csn1s1P19228 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csn1s1P19228 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csn1s1P19228 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csn1s1P19228 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csn1s1P19228 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csn1s1P19228 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csn1s1P19228 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csn1s1P19228 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csn1s1P19228 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Csn1s1P19228 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csn1s1P19228 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csn1s1P19228 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csn1s1P19228 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Csn1s1P19228 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csn1s1P19228 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csn1s1P19228 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csn1s1P19228 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csn1s1P19228 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csn1s1P19228 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csn1s1P19228 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csn1s1P19228 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms