Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga5P11688 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga5P11688 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga5P11688 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga5P11688 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga5P11688 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga5P11688 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga5P11688 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga5P11688 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga5P11688 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga5P11688 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga5P11688 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga5P11688 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga5P11688 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga5P11688 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga5P11688 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga5P11688 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga5P11688 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga5P11688 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga5P11688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga5P11688 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga5P11688 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga5P11688 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga5P11688 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga5P11688 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga5P11688 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga5P11688 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga5P11688 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga5P11688 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga5P11688 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga5P11688 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga5P11688 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga5P11688 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga5P11688 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itga5P11688 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga5P11688 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga5P11688 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga5P11688 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga5P11688 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga5P11688 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga5P11688 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga5P11688 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga5P11688 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga5P11688 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga5P11688 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga5P11688 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga5P11688 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga5P11688 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga5P11688 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga5P11688 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga5P11688 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga5P11688 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga5P11688 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga5P11688 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga5P11688 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga5P11688 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga5P11688 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga5P11688 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga5P11688 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga5P11688 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga5P11688 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga5P11688 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga5P11688 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga5P11688 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga5P11688 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga5P11688 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms