Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hoxc8P09025 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Hoxc8P09025 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Hoxc8P09025 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hoxc8P09025 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxc8P09025 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxc8P09025 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxc8P09025 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxc8P09025 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Hoxc8P09025 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxc8P09025 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hoxc8P09025 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Hoxc8P09025 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hoxc8P09025 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hoxc8P09025 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxc8P09025 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hoxc8P09025 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Hoxc8P09025 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Hoxc8P09025 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hoxc8P09025 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Hoxc8P09025 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hoxc8P09025 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxc8P09025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hoxc8P09025 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxc8P09025 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxc8P09025 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hoxc8P09025 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hoxc8P09025 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hoxc8P09025 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hoxc8P09025 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Hoxc8P09025 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hoxc8P09025 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hoxc8P09025 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxc8P09025 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxc8P09025 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxc8P09025 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Hoxc8P09025 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxc8P09025 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxc8P09025 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxc8P09025 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxc8P09025 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxc8P09025 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxc8P09025 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxc8P09025 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxc8P09025 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxc8P09025 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxc8P09025 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxc8P09025 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxc8P09025 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxc8P09025 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxc8P09025 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxc8P09025 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxc8P09025 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxc8P09025 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxc8P09025 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxc8P09025 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxc8P09025 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxc8P09025 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxc8P09025 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxc8P09025 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Hoxc8P09025 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxc8P09025 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxc8P09025 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hoxc8P09025 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hoxc8P09025 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hoxc8P09025 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxc8P09025 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc8P09025 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hoxc8P09025 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc8P09025 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc8P09025 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxc8P09025 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc8P09025 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc8P09025 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc8P09025 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxc8P09025 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxc8P09025 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc8P09025 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxc8P09025 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxc8P09025 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc8P09025 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc8P09025 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxc8P09025 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc8P09025 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc8P09025 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxc8P09025 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxc8P09025 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxc8P09025 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxc8P09025 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxc8P09025 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxc8P09025 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms