Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Hoxb7P09024 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Hoxb7P09024 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Hoxb7P09024 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Hoxb7P09024 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Hoxb7P09024 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Hoxb7P09024 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Hoxb7P09024 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Hoxb7P09024 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Hoxb7P09024 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Hoxb7P09024 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Hoxb7P09024 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Hoxb7P09024 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Hoxb7P09024 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Hoxb7P09024 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Hoxb7P09024 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Hoxb7P09024 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Hoxb7P09024 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Hoxb7P09024 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Hoxb7P09024 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Hoxb7P09024 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Hoxb7P09024 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Hoxb7P09024 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Hoxb7P09024 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Hoxb7P09024 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Hoxb7P09024 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Hoxb7P09024 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hoxb7P09024 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hoxb7P09024 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hoxb7P09024 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Hoxb7P09024 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hoxb7P09024 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hoxb7P09024 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hoxb7P09024 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Hoxb7P09024 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Hoxb7P09024 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Hoxb7P09024 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Hoxb7P09024 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hoxb7P09024 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Hoxb7P09024 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Hoxb7P09024 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Hoxb7P09024 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hoxb7P09024 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Hoxb7P09024 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Hoxb7P09024 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hoxb7P09024 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Hoxb7P09024 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Hoxb7P09024 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Hoxb7P09024 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hoxb7P09024 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Hoxb7P09024 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hoxb7P09024 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Hoxb7P09024 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hoxb7P09024 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hoxb7P09024 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Hoxb7P09024 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Hoxb7P09024 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Hoxb7P09024 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Hoxb7P09024 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Hoxb7P09024 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Hoxb7P09024 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hoxb7P09024 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hoxb7P09024 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hoxb7P09024 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hoxb7P09024 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Hoxb7P09024 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Hoxb7P09024 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Hoxb7P09024 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Hoxb7P09024 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Hoxb7P09024 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Hoxb7P09024 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hoxb7P09024 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hoxb7P09024 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Hoxb7P09024 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hoxb7P09024 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hoxb7P09024 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Hoxb7P09024 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Hoxb7P09024 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Hoxb7P09024 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Hoxb7P09024 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Hoxb7P09024 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Hoxb7P09024 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Hoxb7P09024 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Hoxb7P09024 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Hoxb7P09024 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Hoxb7P09024 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Hoxb7P09024 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Hoxb7P09024 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Hoxb7P09024 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hoxb7P09024 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hoxb7P09024 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Hoxb7P09024 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Hoxb7P09024 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms