Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Hoxb7P09024 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Hoxb7P09024 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Hoxb7P09024 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Hoxb7P09024 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Hoxb7P09024 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,54■■■■□ 3,6
Hoxb7P09024 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Hoxb7P09024 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Hoxb7P09024 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,43■■■■□ 3,58
Hoxb7P09024 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Hoxb7P09024 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Hoxb7P09024 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Hoxb7P09024 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Hoxb7P09024 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Hoxb7P09024 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Hoxb7P09024 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Hoxb7P09024 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,2■■■■□ 3,54
Hoxb7P09024 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Hoxb7P09024 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Hoxb7P09024 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Hoxb7P09024 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Hoxb7P09024 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Hoxb7P09024 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Hoxb7P09024 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Hoxb7P09024 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Hoxb7P09024 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Hoxb7P09024 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Hoxb7P09024 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Hoxb7P09024 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Hoxb7P09024 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Hoxb7P09024 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Hoxb7P09024 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Hoxb7P09024 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Hoxb7P09024 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,72■■■■□ 3,47
Hoxb7P09024 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Hoxb7P09024 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Hoxb7P09024 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Hoxb7P09024 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Hoxb7P09024 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Hoxb7P09024 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36,57■■■■□ 3,44
Hoxb7P09024 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Hoxb7P09024 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Hoxb7P09024 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Hoxb7P09024 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Hoxb7P09024 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Hoxb7P09024 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Hoxb7P09024 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Hoxb7P09024 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Hoxb7P09024 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Hoxb7P09024 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Hoxb7P09024 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Hoxb7P09024 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Hoxb7P09024 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Hoxb7P09024 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Hoxb7P09024 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Hoxb7P09024 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Hoxb7P09024 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Hoxb7P09024 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Hoxb7P09024 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Hoxb7P09024 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Hoxb7P09024 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Hoxb7P09024 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Hoxb7P09024 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Hoxb7P09024 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Hoxb7P09024 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Hoxb7P09024 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Hoxb7P09024 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Hoxb7P09024 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Hoxb7P09024 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Hoxb7P09024 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Hoxb7P09024 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Hoxb7P09024 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Hoxb7P09024 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Hoxb7P09024 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Hoxb7P09024 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Hoxb7P09024 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Hoxb7P09024 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Hoxb7P09024 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,77■■■■□ 3,32
Hoxb7P09024 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,31
Hoxb7P09024 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Hoxb7P09024 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Hoxb7P09024 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Hoxb7P09024 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Hoxb7P09024 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Hoxb7P09024 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Hoxb7P09024 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Hoxb7P09024 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Hoxb7P09024 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Hoxb7P09024 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Hoxb7P09024 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Hoxb7P09024 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35,56■■■■□ 3,28
Hoxb7P09024 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Hoxb7P09024 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,1 ms