Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb6P09023 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb6P09023 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb6P09023 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb6P09023 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb6P09023 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb6P09023 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb6P09023 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb6P09023 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb6P09023 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb6P09023 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb6P09023 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb6P09023 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb6P09023 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb6P09023 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb6P09023 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb6P09023 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb6P09023 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb6P09023 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb6P09023 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb6P09023 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb6P09023 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb6P09023 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb6P09023 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxb6P09023 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxb6P09023 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb6P09023 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb6P09023 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb6P09023 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb6P09023 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb6P09023 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb6P09023 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb6P09023 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxb6P09023 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb6P09023 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb6P09023 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxb6P09023 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb6P09023 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb6P09023 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb6P09023 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb6P09023 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb6P09023 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxb6P09023 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb6P09023 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb6P09023 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb6P09023 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb6P09023 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxb6P09023 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb6P09023 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb6P09023 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb6P09023 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb6P09023 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb6P09023 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxb6P09023 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb6P09023 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb6P09023 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb6P09023 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb6P09023 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb6P09023 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb6P09023 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb6P09023 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb6P09023 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb6P09023 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb6P09023 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb6P09023 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb6P09023 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb6P09023 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb6P09023 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb6P09023 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb6P09023 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb6P09023 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb6P09023 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms