Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
TtrP07309 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
TtrP07309 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
TtrP07309 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
TtrP07309 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
TtrP07309 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
TtrP07309 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,42■□□□□ 0,7
TtrP07309 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
TtrP07309 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,39■□□□□ 0,7
TtrP07309 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
TtrP07309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19,36■□□□□ 0,69
TtrP07309 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
TtrP07309 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,32■□□□□ 0,68
TtrP07309 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
TtrP07309 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
TtrP07309 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
TtrP07309 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
TtrP07309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19,26■□□□□ 0,67
TtrP07309 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
TtrP07309 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
TtrP07309 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
TtrP07309 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
TtrP07309 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
TtrP07309 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19,2■□□□□ 0,66
TtrP07309 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
TtrP07309 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
TtrP07309 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19,16■□□□□ 0,66
TtrP07309 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,15■□□□□ 0,66
TtrP07309 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
TtrP07309 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
TtrP07309 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
TtrP07309 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
TtrP07309 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
TtrP07309 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
TtrP07309 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
TtrP07309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,05■□□□□ 0,64
TtrP07309 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,05■□□□□ 0,64
TtrP07309 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
TtrP07309 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
TtrP07309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
TtrP07309 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
TtrP07309 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
TtrP07309 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
TtrP07309 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0,63
TtrP07309 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
TtrP07309 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18,98■□□□□ 0,63
TtrP07309 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
TtrP07309 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
TtrP07309 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18,96■□□□□ 0,63
TtrP07309 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
TtrP07309 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
TtrP07309 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
TtrP07309 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
TtrP07309 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18,92■□□□□ 0,62
TtrP07309 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
TtrP07309 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
TtrP07309 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
TtrP07309 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,89■□□□□ 0,61
TtrP07309 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
TtrP07309 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
TtrP07309 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18,86■□□□□ 0,61
TtrP07309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
TtrP07309 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18,85■□□□□ 0,61
TtrP07309 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18,85■□□□□ 0,61
TtrP07309 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18,84■□□□□ 0,61
TtrP07309 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
TtrP07309 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
TtrP07309 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
TtrP07309 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
TtrP07309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
TtrP07309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
TtrP07309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18,74■□□□□ 0,59
TtrP07309 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
TtrP07309 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,72■□□□□ 0,59
TtrP07309 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
TtrP07309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
TtrP07309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
TtrP07309 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,68■□□□□ 0,58
TtrP07309 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
TtrP07309 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
TtrP07309 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
TtrP07309 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
TtrP07309 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
TtrP07309 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
TtrP07309 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
TtrP07309 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
TtrP07309 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
TtrP07309 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
TtrP07309 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
TtrP07309 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
TtrP07309 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
TtrP07309 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
TtrP07309 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,62■□□□□ 0,57
TtrP07309 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18,59■□□□□ 0,57
TtrP07309 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
TtrP07309 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,57■□□□□ 0,56
TtrP07309 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18,57■□□□□ 0,56
TtrP07309 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
TtrP07309 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
TtrP07309 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,55■□□□□ 0,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms