Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Lamc1P02468 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Lamc1P02468 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Lamc1P02468 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Lamc1P02468 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Lamc1P02468 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lamc1P02468 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Lamc1P02468 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Lamc1P02468 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Lamc1P02468 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Lamc1P02468 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Lamc1P02468 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Lamc1P02468 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Lamc1P02468 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Lamc1P02468 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Lamc1P02468 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Lamc1P02468 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Lamc1P02468 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Lamc1P02468 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Lamc1P02468 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Lamc1P02468 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Lamc1P02468 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Lamc1P02468 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Lamc1P02468 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Lamc1P02468 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Lamc1P02468 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Lamc1P02468 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lamc1P02468 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lamc1P02468 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Lamc1P02468 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Lamc1P02468 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Lamc1P02468 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Lamc1P02468 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Lamc1P02468 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Lamc1P02468 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Lamc1P02468 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Lamc1P02468 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lamc1P02468 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
Lamc1P02468 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
Lamc1P02468 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Lamc1P02468 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Lamc1P02468 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Lamc1P02468 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Lamc1P02468 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Lamc1P02468 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Lamc1P02468 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Lamc1P02468 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Lamc1P02468 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Lamc1P02468 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Lamc1P02468 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc1P02468 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc1P02468 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc1P02468 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lamc1P02468 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lamc1P02468 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Lamc1P02468 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Lamc1P02468 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Lamc1P02468 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Lamc1P02468 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Lamc1P02468 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Lamc1P02468 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Lamc1P02468 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Lamc1P02468 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Lamc1P02468 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Lamc1P02468 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Lamc1P02468 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Lamc1P02468 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Lamc1P02468 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Lamc1P02468 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Lamc1P02468 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Lamc1P02468 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lamc1P02468 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lamc1P02468 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Lamc1P02468 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Lamc1P02468 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Lamc1P02468 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
Lamc1P02468 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc1P02468 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Lamc1P02468 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Lamc1P02468 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lamc1P02468 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Lamc1P02468 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc1P02468 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Lamc1P02468 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lamc1P02468 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Lamc1P02468 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Lamc1P02468 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Lamc1P02468 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lamc1P02468 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Lamc1P02468 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Lamc1P02468 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lamc1P02468 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Lamc1P02468 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Lamc1P02468 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms