Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Igk-V19-17P01633 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Igk-V19-17P01633 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Igk-V19-17P01633 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Igk-V19-17P01633 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Igk-V19-17P01633 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Igk-V19-17P01633 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Igk-V19-17P01633 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Igk-V19-17P01633 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Igk-V19-17P01633 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Igk-V19-17P01633 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Igk-V19-17P01633 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Igk-V19-17P01633 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Igk-V19-17P01633 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Igk-V19-17P01633 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Igk-V19-17P01633 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Igk-V19-17P01633 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Igk-V19-17P01633 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Igk-V19-17P01633 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Igk-V19-17P01633 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Igk-V19-17P01633 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Igk-V19-17P01633 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Igk-V19-17P01633 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Igk-V19-17P01633 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Igk-V19-17P01633 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Igk-V19-17P01633 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Igk-V19-17P01633 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Igk-V19-17P01633 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Igk-V19-17P01633 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Igk-V19-17P01633 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Igk-V19-17P01633 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Igk-V19-17P01633 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Igk-V19-17P01633 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Igk-V19-17P01633 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Igk-V19-17P01633 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Igk-V19-17P01633 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Igk-V19-17P01633 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Igk-V19-17P01633 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Igk-V19-17P01633 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Igk-V19-17P01633 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Igk-V19-17P01633 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Igk-V19-17P01633 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Igk-V19-17P01633 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Igk-V19-17P01633 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Igk-V19-17P01633 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Igk-V19-17P01633 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Igk-V19-17P01633 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Igk-V19-17P01633 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Igk-V19-17P01633 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Igk-V19-17P01633 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Igk-V19-17P01633 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Igk-V19-17P01633 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Igk-V19-17P01633 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Igk-V19-17P01633 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Igk-V19-17P01633 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Igk-V19-17P01633 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Igk-V19-17P01633 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Igk-V19-17P01633 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Igk-V19-17P01633 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Igk-V19-17P01633 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Igk-V19-17P01633 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Igk-V19-17P01633 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Igk-V19-17P01633 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Igk-V19-17P01633 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Igk-V19-17P01633 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Igk-V19-17P01633 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Igk-V19-17P01633 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Igk-V19-17P01633 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Igk-V19-17P01633 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Igk-V19-17P01633 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms