Protein–RNA interactions for Protein: P01132

Egf, Pro-epidermal growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfP01132 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
EgfP01132 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
EgfP01132 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
EgfP01132 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
EgfP01132 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
EgfP01132 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
EgfP01132 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
EgfP01132 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,19■■■□□ 2,42
EgfP01132 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
EgfP01132 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
EgfP01132 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
EgfP01132 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
EgfP01132 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,4
EgfP01132 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
EgfP01132 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
EgfP01132 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
EgfP01132 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
EgfP01132 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
EgfP01132 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
EgfP01132 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
EgfP01132 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
EgfP01132 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
EgfP01132 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
EgfP01132 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
EgfP01132 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
EgfP01132 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
EgfP01132 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
EgfP01132 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
EgfP01132 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
EgfP01132 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
EgfP01132 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
EgfP01132 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
EgfP01132 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
EgfP01132 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
EgfP01132 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
EgfP01132 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
EgfP01132 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,49■■■□□ 2,31
EgfP01132 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
EgfP01132 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
EgfP01132 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
EgfP01132 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
EgfP01132 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
EgfP01132 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
EgfP01132 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
EgfP01132 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
EgfP01132 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
EgfP01132 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
EgfP01132 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
EgfP01132 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,36■■■□□ 2,29
EgfP01132 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
EgfP01132 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
EgfP01132 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
EgfP01132 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
EgfP01132 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
EgfP01132 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
EgfP01132 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
EgfP01132 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
EgfP01132 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
EgfP01132 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
EgfP01132 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
EgfP01132 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
EgfP01132 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
EgfP01132 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
EgfP01132 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
EgfP01132 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
EgfP01132 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
EgfP01132 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
EgfP01132 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
EgfP01132 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
EgfP01132 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
EgfP01132 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
EgfP01132 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
EgfP01132 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
EgfP01132 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
EgfP01132 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
EgfP01132 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
EgfP01132 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
EgfP01132 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
EgfP01132 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
EgfP01132 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
EgfP01132 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
EgfP01132 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
EgfP01132 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
EgfP01132 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
EgfP01132 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
EgfP01132 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
EgfP01132 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
EgfP01132 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
EgfP01132 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
EgfP01132 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
EgfP01132 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
EgfP01132 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
EgfP01132 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
EgfP01132 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
EgfP01132 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
EgfP01132 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
EgfP01132 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
EgfP01132 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
EgfP01132 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
EgfP01132 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,9 ms