Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serf1O88892 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serf1O88892 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Serf1O88892 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serf1O88892 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serf1O88892 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serf1O88892 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serf1O88892 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serf1O88892 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serf1O88892 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serf1O88892 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serf1O88892 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serf1O88892 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serf1O88892 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serf1O88892 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Serf1O88892 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Serf1O88892 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serf1O88892 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serf1O88892 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serf1O88892 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serf1O88892 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serf1O88892 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serf1O88892 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serf1O88892 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serf1O88892 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serf1O88892 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serf1O88892 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serf1O88892 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Serf1O88892 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Serf1O88892 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serf1O88892 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Serf1O88892 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serf1O88892 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serf1O88892 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serf1O88892 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Serf1O88892 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serf1O88892 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serf1O88892 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Serf1O88892 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serf1O88892 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serf1O88892 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serf1O88892 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serf1O88892 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serf1O88892 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serf1O88892 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serf1O88892 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Serf1O88892 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serf1O88892 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serf1O88892 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serf1O88892 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serf1O88892 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serf1O88892 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serf1O88892 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serf1O88892 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Serf1O88892 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms