Protein–RNA interactions for Protein: O70562

Sprr2k, Small proline-rich protein 2K, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr2kO70562 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11,26□□□□□ -0,61
Sprr2kO70562 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,23□□□□□ -0,61
Sprr2kO70562 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC11,23□□□□□ -0,61
Sprr2kO70562 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC11,22□□□□□ -0,61
Sprr2kO70562 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC11,21□□□□□ -0,61
Sprr2kO70562 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,21□□□□□ -0,61
Sprr2kO70562 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC11,2□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC11,2□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11,19□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC11,19□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,19□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11,17□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC11,15□□□□□ -0,62
Sprr2kO70562 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11,13□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC11,13□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11,13□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC11,12□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,12□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,1□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC11,09□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC11,09□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,09□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11,09□□□□□ -0,63
Sprr2kO70562 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,08□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC11,08□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC11,07□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11,07□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC11,07□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11,06□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11,06□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC11,06□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,06□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11,05□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11,05□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC11,05□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC11,04□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC11,03□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,03□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC11,03□□□□□ -0,64
Sprr2kO70562 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11,02□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC11,02□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,99□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10,99□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10,99□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10,98□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10,98□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10,97□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,96□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10,96□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10,96□□□□□ -0,65
Sprr2kO70562 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10,95□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10,94□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10,94□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC10,94□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,93□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC10,92□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,92□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,9□□□□□ -0,66
Sprr2kO70562 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10,89□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10,89□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10,89□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10,89□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10,88□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10,87□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,87□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC10,87□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,87□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC10,85□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC10,85□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10,85□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10,84□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10,84□□□□□ -0,67
Sprr2kO70562 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10,83□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,83□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,83□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10,82□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC10,82□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,81□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10,81□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,81□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10,8□□□□□ -0,68
Sprr2kO70562 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC10,77□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC10,76□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10,75□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC10,75□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10,74□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10,74□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC10,73□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10,71□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10,71□□□□□ -0,69
Sprr2kO70562 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC10,7□□□□□ -0,7
Sprr2kO70562 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,7□□□□□ -0,7
Sprr2kO70562 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC10,69□□□□□ -0,7
Sprr2kO70562 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC10,69□□□□□ -0,7
Sprr2kO70562 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC10,68□□□□□ -0,7
Sprr2kO70562 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10,68□□□□□ -0,7
Sprr2kO70562 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,68□□□□□ -0,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms