Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Rgs9O54828 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Rgs9O54828 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,73
Rgs9O54828 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Rgs9O54828 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Rgs9O54828 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Rgs9O54828 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Rgs9O54828 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Rgs9O54828 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Rgs9O54828 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Rgs9O54828 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Rgs9O54828 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Rgs9O54828 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Rgs9O54828 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Rgs9O54828 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Rgs9O54828 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Rgs9O54828 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Rgs9O54828 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Rgs9O54828 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Rgs9O54828 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Rgs9O54828 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Rgs9O54828 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,7■■■□□ 2,66
Rgs9O54828 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Rgs9O54828 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Rgs9O54828 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Rgs9O54828 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Rgs9O54828 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Rgs9O54828 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,51■■■□□ 2,64
Rgs9O54828 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Rgs9O54828 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Rgs9O54828 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Rgs9O54828 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rgs9O54828 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Rgs9O54828 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Rgs9O54828 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Rgs9O54828 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rgs9O54828 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Rgs9O54828 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Rgs9O54828 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Rgs9O54828 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rgs9O54828 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Rgs9O54828 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Rgs9O54828 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Rgs9O54828 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Rgs9O54828 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Rgs9O54828 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Rgs9O54828 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Rgs9O54828 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Rgs9O54828 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Rgs9O54828 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Rgs9O54828 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Rgs9O54828 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Rgs9O54828 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Rgs9O54828 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Rgs9O54828 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Rgs9O54828 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Rgs9O54828 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Rgs9O54828 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Rgs9O54828 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Rgs9O54828 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Rgs9O54828 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Rgs9O54828 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rgs9O54828 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Rgs9O54828 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Rgs9O54828 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Rgs9O54828 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Rgs9O54828 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rgs9O54828 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rgs9O54828 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
Rgs9O54828 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Rgs9O54828 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Rgs9O54828 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Rgs9O54828 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Rgs9O54828 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Rgs9O54828 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Rgs9O54828 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Rgs9O54828 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Rgs9O54828 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Rgs9O54828 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Rgs9O54828 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Rgs9O54828 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Rgs9O54828 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Rgs9O54828 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Rgs9O54828 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Rgs9O54828 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Rgs9O54828 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms