Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Cited2O35740 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Cited2O35740 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Cited2O35740 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Cited2O35740 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Cited2O35740 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Cited2O35740 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Cited2O35740 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Cited2O35740 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Cited2O35740 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Cited2O35740 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1,11
Cited2O35740 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Cited2O35740 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Cited2O35740 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Cited2O35740 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Cited2O35740 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Cited2O35740 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Cited2O35740 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Cited2O35740 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Cited2O35740 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Cited2O35740 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Cited2O35740 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Cited2O35740 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Cited2O35740 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Cited2O35740 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Cited2O35740 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Cited2O35740 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cited2O35740 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cited2O35740 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cited2O35740 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cited2O35740 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cited2O35740 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Cited2O35740 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cited2O35740 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cited2O35740 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cited2O35740 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Cited2O35740 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Cited2O35740 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cited2O35740 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cited2O35740 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Cited2O35740 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cited2O35740 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cited2O35740 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Cited2O35740 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Cited2O35740 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cited2O35740 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Cited2O35740 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Cited2O35740 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Cited2O35740 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Cited2O35740 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Cited2O35740 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Cited2O35740 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Cited2O35740 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Cited2O35740 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Cited2O35740 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Cited2O35740 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Cited2O35740 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Cited2O35740 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Cited2O35740 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Cited2O35740 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Cited2O35740 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cited2O35740 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Cited2O35740 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cited2O35740 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cited2O35740 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cited2O35740 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
Cited2O35740 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cited2O35740 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cited2O35740 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cited2O35740 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
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