Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matn3O35701 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matn3O35701 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matn3O35701 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matn3O35701 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matn3O35701 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matn3O35701 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Matn3O35701 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Matn3O35701 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Matn3O35701 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Matn3O35701 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Matn3O35701 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Matn3O35701 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Matn3O35701 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn3O35701 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn3O35701 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Matn3O35701 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Matn3O35701 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Matn3O35701 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Matn3O35701 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matn3O35701 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Matn3O35701 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Matn3O35701 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matn3O35701 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matn3O35701 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Matn3O35701 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matn3O35701 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matn3O35701 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matn3O35701 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matn3O35701 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matn3O35701 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matn3O35701 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matn3O35701 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn3O35701 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn3O35701 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matn3O35701 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matn3O35701 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matn3O35701 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matn3O35701 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matn3O35701 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn3O35701 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn3O35701 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matn3O35701 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn3O35701 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matn3O35701 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matn3O35701 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn3O35701 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn3O35701 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matn3O35701 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matn3O35701 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matn3O35701 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matn3O35701 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Matn3O35701 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Matn3O35701 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Matn3O35701 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Matn3O35701 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Matn3O35701 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Matn3O35701 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Matn3O35701 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Matn3O35701 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Matn3O35701 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Matn3O35701 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Matn3O35701 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Matn3O35701 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn3O35701 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn3O35701 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn3O35701 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn3O35701 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Matn3O35701 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Matn3O35701 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms