Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnxbO35452 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TnxbO35452 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnxbO35452 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TnxbO35452 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnxbO35452 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnxbO35452 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnxbO35452 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnxbO35452 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnxbO35452 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnxbO35452 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnxbO35452 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnxbO35452 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TnxbO35452 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnxbO35452 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnxbO35452 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnxbO35452 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TnxbO35452 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnxbO35452 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnxbO35452 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnxbO35452 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnxbO35452 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnxbO35452 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnxbO35452 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnxbO35452 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnxbO35452 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TnxbO35452 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TnxbO35452 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TnxbO35452 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TnxbO35452 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TnxbO35452 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TnxbO35452 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TnxbO35452 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TnxbO35452 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TnxbO35452 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TnxbO35452 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TnxbO35452 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TnxbO35452 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TnxbO35452 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TnxbO35452 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TnxbO35452 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TnxbO35452 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TnxbO35452 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TnxbO35452 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TnxbO35452 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TnxbO35452 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TnxbO35452 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TnxbO35452 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TnxbO35452 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TnxbO35452 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TnxbO35452 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TnxbO35452 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TnxbO35452 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnxbO35452 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnxbO35452 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms