Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H2-M9O19442 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H2-M9O19442 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H2-M9O19442 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
H2-M9O19442 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H2-M9O19442 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H2-M9O19442 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H2-M9O19442 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H2-M9O19442 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H2-M9O19442 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H2-M9O19442 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H2-M9O19442 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H2-M9O19442 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
H2-M9O19442 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H2-M9O19442 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H2-M9O19442 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H2-M9O19442 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2-M9O19442 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
H2-M9O19442 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H2-M9O19442 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H2-M9O19442 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H2-M9O19442 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H2-M9O19442 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H2-M9O19442 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H2-M9O19442 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H2-M9O19442 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2-M9O19442 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H2-M9O19442 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H2-M9O19442 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H2-M9O19442 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H2-M9O19442 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H2-M9O19442 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-M9O19442 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H2-M9O19442 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
H2-M9O19442 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
H2-M9O19442 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H2-M9O19442 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
H2-M9O19442 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-M9O19442 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2-M9O19442 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2-M9O19442 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2-M9O19442 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2-M9O19442 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2-M9O19442 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2-M9O19442 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-M9O19442 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-M9O19442 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-M9O19442 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-M9O19442 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-M9O19442 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2-M9O19442 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2-M9O19442 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2-M9O19442 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2-M9O19442 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2-M9O19442 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2-M9O19442 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2-M9O19442 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2-M9O19442 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2-M9O19442 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2-M9O19442 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2-M9O19442 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2-M9O19442 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2-M9O19442 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2-M9O19442 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
H2-M9O19442 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2-M9O19442 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2-M9O19442 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2-M9O19442 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2-M9O19442 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2-M9O19442 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2-M9O19442 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2-M9O19442 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2-M9O19442 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H2-M9O19442 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H2-M9O19442 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2-M9O19442 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
H2-M9O19442 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
H2-M9O19442 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms