Protein–RNA interactions for Protein: K7N6T7

Gm2897, Predicted gene 2897, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2897K7N6T7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm2897K7N6T7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm2897K7N6T7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm2897K7N6T7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm2897K7N6T7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm2897K7N6T7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm2897K7N6T7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gm2897K7N6T7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm2897K7N6T7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm2897K7N6T7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm2897K7N6T7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm2897K7N6T7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm2897K7N6T7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gm2897K7N6T7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm2897K7N6T7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm2897K7N6T7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm2897K7N6T7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm2897K7N6T7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm2897K7N6T7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm2897K7N6T7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm2897K7N6T7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm2897K7N6T7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm2897K7N6T7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm2897K7N6T7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm2897K7N6T7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm2897K7N6T7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm2897K7N6T7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm2897K7N6T7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm2897K7N6T7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm2897K7N6T7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm2897K7N6T7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm2897K7N6T7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm2897K7N6T7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm2897K7N6T7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm2897K7N6T7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm2897K7N6T7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm2897K7N6T7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm2897K7N6T7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm2897K7N6T7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm2897K7N6T7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm2897K7N6T7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm2897K7N6T7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm2897K7N6T7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm2897K7N6T7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm2897K7N6T7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm2897K7N6T7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm2897K7N6T7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm2897K7N6T7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm2897K7N6T7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm2897K7N6T7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm2897K7N6T7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm2897K7N6T7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm2897K7N6T7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm2897K7N6T7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm2897K7N6T7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm2897K7N6T7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm2897K7N6T7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm2897K7N6T7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gm2897K7N6T7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm2897K7N6T7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm2897K7N6T7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm2897K7N6T7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm2897K7N6T7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm2897K7N6T7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm2897K7N6T7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm2897K7N6T7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm2897K7N6T7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm2897K7N6T7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm2897K7N6T7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm2897K7N6T7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm2897K7N6T7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm2897K7N6T7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm2897K7N6T7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm2897K7N6T7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm2897K7N6T7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm2897K7N6T7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm2897K7N6T7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm2897K7N6T7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm2897K7N6T7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm2897K7N6T7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms