Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Smim22J3QP37 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Smim22J3QP37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Smim22J3QP37 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Smim22J3QP37 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Smim22J3QP37 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Smim22J3QP37 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Smim22J3QP37 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Smim22J3QP37 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Smim22J3QP37 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Smim22J3QP37 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Smim22J3QP37 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Smim22J3QP37 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Smim22J3QP37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Smim22J3QP37 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Smim22J3QP37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Smim22J3QP37 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Smim22J3QP37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Smim22J3QP37 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Smim22J3QP37 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Smim22J3QP37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Smim22J3QP37 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Smim22J3QP37 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Smim22J3QP37 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Smim22J3QP37 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Smim22J3QP37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Smim22J3QP37 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Smim22J3QP37 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Smim22J3QP37 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Smim22J3QP37 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Smim22J3QP37 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Smim22J3QP37 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Smim22J3QP37 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Smim22J3QP37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Smim22J3QP37 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Smim22J3QP37 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Smim22J3QP37 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Smim22J3QP37 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Smim22J3QP37 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Smim22J3QP37 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Smim22J3QP37 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Smim22J3QP37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Smim22J3QP37 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Smim22J3QP37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Smim22J3QP37 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Smim22J3QP37 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Smim22J3QP37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Smim22J3QP37 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Smim22J3QP37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Smim22J3QP37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Smim22J3QP37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Smim22J3QP37 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Smim22J3QP37 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Smim22J3QP37 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Smim22J3QP37 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Smim22J3QP37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Smim22J3QP37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Smim22J3QP37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Smim22J3QP37 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Smim22J3QP37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Smim22J3QP37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Smim22J3QP37 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Smim22J3QP37 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Smim22J3QP37 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Smim22J3QP37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Smim22J3QP37 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Smim22J3QP37 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Smim22J3QP37 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Smim22J3QP37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Smim22J3QP37 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Smim22J3QP37 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Smim22J3QP37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Smim22J3QP37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Smim22J3QP37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Smim22J3QP37 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Smim22J3QP37 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Smim22J3QP37 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Smim22J3QP37 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Smim22J3QP37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms