Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SmgcF6VRN1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SmgcF6VRN1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SmgcF6VRN1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SmgcF6VRN1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SmgcF6VRN1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SmgcF6VRN1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SmgcF6VRN1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SmgcF6VRN1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SmgcF6VRN1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SmgcF6VRN1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SmgcF6VRN1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SmgcF6VRN1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SmgcF6VRN1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SmgcF6VRN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SmgcF6VRN1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SmgcF6VRN1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SmgcF6VRN1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SmgcF6VRN1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SmgcF6VRN1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SmgcF6VRN1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SmgcF6VRN1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SmgcF6VRN1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SmgcF6VRN1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SmgcF6VRN1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SmgcF6VRN1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SmgcF6VRN1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SmgcF6VRN1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SmgcF6VRN1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SmgcF6VRN1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SmgcF6VRN1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SmgcF6VRN1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SmgcF6VRN1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SmgcF6VRN1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SmgcF6VRN1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SmgcF6VRN1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SmgcF6VRN1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SmgcF6VRN1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SmgcF6VRN1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SmgcF6VRN1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SmgcF6VRN1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SmgcF6VRN1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SmgcF6VRN1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SmgcF6VRN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SmgcF6VRN1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SmgcF6VRN1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SmgcF6VRN1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SmgcF6VRN1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SmgcF6VRN1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SmgcF6VRN1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SmgcF6VRN1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SmgcF6VRN1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SmgcF6VRN1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SmgcF6VRN1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SmgcF6VRN1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SmgcF6VRN1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SmgcF6VRN1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SmgcF6VRN1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SmgcF6VRN1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SmgcF6VRN1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SmgcF6VRN1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SmgcF6VRN1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SmgcF6VRN1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SmgcF6VRN1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SmgcF6VRN1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SmgcF6VRN1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SmgcF6VRN1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SmgcF6VRN1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SmgcF6VRN1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SmgcF6VRN1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SmgcF6VRN1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SmgcF6VRN1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SmgcF6VRN1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SmgcF6VRN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SmgcF6VRN1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SmgcF6VRN1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SmgcF6VRN1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SmgcF6VRN1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SmgcF6VRN1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SmgcF6VRN1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SmgcF6VRN1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SmgcF6VRN1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SmgcF6VRN1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SmgcF6VRN1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SmgcF6VRN1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SmgcF6VRN1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SmgcF6VRN1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SmgcF6VRN1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SmgcF6VRN1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SmgcF6VRN1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SmgcF6VRN1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SmgcF6VRN1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms