Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sptbn5F6UCX4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sptbn5F6UCX4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sptbn5F6UCX4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sptbn5F6UCX4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sptbn5F6UCX4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sptbn5F6UCX4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sptbn5F6UCX4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sptbn5F6UCX4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sptbn5F6UCX4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sptbn5F6UCX4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sptbn5F6UCX4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sptbn5F6UCX4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sptbn5F6UCX4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sptbn5F6UCX4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sptbn5F6UCX4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sptbn5F6UCX4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Sptbn5F6UCX4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sptbn5F6UCX4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Sptbn5F6UCX4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sptbn5F6UCX4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sptbn5F6UCX4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sptbn5F6UCX4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sptbn5F6UCX4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Sptbn5F6UCX4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Sptbn5F6UCX4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sptbn5F6UCX4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sptbn5F6UCX4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sptbn5F6UCX4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sptbn5F6UCX4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sptbn5F6UCX4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sptbn5F6UCX4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sptbn5F6UCX4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sptbn5F6UCX4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sptbn5F6UCX4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sptbn5F6UCX4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sptbn5F6UCX4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Sptbn5F6UCX4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sptbn5F6UCX4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sptbn5F6UCX4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sptbn5F6UCX4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sptbn5F6UCX4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sptbn5F6UCX4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sptbn5F6UCX4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sptbn5F6UCX4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sptbn5F6UCX4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sptbn5F6UCX4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sptbn5F6UCX4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sptbn5F6UCX4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sptbn5F6UCX4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sptbn5F6UCX4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sptbn5F6UCX4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Sptbn5F6UCX4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sptbn5F6UCX4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sptbn5F6UCX4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Sptbn5F6UCX4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sptbn5F6UCX4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sptbn5F6UCX4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sptbn5F6UCX4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Sptbn5F6UCX4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sptbn5F6UCX4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sptbn5F6UCX4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sptbn5F6UCX4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sptbn5F6UCX4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sptbn5F6UCX4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sptbn5F6UCX4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sptbn5F6UCX4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sptbn5F6UCX4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Sptbn5F6UCX4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Sptbn5F6UCX4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sptbn5F6UCX4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sptbn5F6UCX4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sptbn5F6UCX4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sptbn5F6UCX4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sptbn5F6UCX4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sptbn5F6UCX4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sptbn5F6UCX4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Sptbn5F6UCX4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sptbn5F6UCX4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sptbn5F6UCX4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms