Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
UtrnE9Q6R7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UtrnE9Q6R7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
UtrnE9Q6R7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
UtrnE9Q6R7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UtrnE9Q6R7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
UtrnE9Q6R7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UtrnE9Q6R7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UtrnE9Q6R7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
UtrnE9Q6R7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
UtrnE9Q6R7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
UtrnE9Q6R7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
UtrnE9Q6R7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UtrnE9Q6R7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UtrnE9Q6R7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
UtrnE9Q6R7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
UtrnE9Q6R7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
UtrnE9Q6R7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UtrnE9Q6R7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UtrnE9Q6R7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
UtrnE9Q6R7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
UtrnE9Q6R7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UtrnE9Q6R7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UtrnE9Q6R7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UtrnE9Q6R7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UtrnE9Q6R7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UtrnE9Q6R7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
UtrnE9Q6R7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
UtrnE9Q6R7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UtrnE9Q6R7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UtrnE9Q6R7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
UtrnE9Q6R7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UtrnE9Q6R7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UtrnE9Q6R7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UtrnE9Q6R7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UtrnE9Q6R7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
UtrnE9Q6R7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
UtrnE9Q6R7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
UtrnE9Q6R7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
UtrnE9Q6R7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UtrnE9Q6R7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UtrnE9Q6R7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
UtrnE9Q6R7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
UtrnE9Q6R7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
UtrnE9Q6R7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
UtrnE9Q6R7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
UtrnE9Q6R7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UtrnE9Q6R7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
UtrnE9Q6R7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UtrnE9Q6R7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UtrnE9Q6R7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
UtrnE9Q6R7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
UtrnE9Q6R7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UtrnE9Q6R7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
UtrnE9Q6R7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
UtrnE9Q6R7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
UtrnE9Q6R7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
UtrnE9Q6R7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
UtrnE9Q6R7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
UtrnE9Q6R7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
UtrnE9Q6R7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UtrnE9Q6R7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
UtrnE9Q6R7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
UtrnE9Q6R7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
UtrnE9Q6R7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
UtrnE9Q6R7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
UtrnE9Q6R7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
UtrnE9Q6R7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
UtrnE9Q6R7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
UtrnE9Q6R7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
UtrnE9Q6R7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
UtrnE9Q6R7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
UtrnE9Q6R7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
UtrnE9Q6R7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UtrnE9Q6R7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UtrnE9Q6R7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
UtrnE9Q6R7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UtrnE9Q6R7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UtrnE9Q6R7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UtrnE9Q6R7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms