Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Sbf2E9PXF8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Sbf2E9PXF8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Sbf2E9PXF8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Sbf2E9PXF8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Sbf2E9PXF8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Sbf2E9PXF8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Sbf2E9PXF8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Sbf2E9PXF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Sbf2E9PXF8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Sbf2E9PXF8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Sbf2E9PXF8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Sbf2E9PXF8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Sbf2E9PXF8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Sbf2E9PXF8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Sbf2E9PXF8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sbf2E9PXF8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sbf2E9PXF8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sbf2E9PXF8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sbf2E9PXF8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sbf2E9PXF8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Sbf2E9PXF8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sbf2E9PXF8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sbf2E9PXF8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sbf2E9PXF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sbf2E9PXF8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Sbf2E9PXF8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Sbf2E9PXF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Sbf2E9PXF8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Sbf2E9PXF8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Sbf2E9PXF8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Sbf2E9PXF8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Sbf2E9PXF8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Sbf2E9PXF8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sbf2E9PXF8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Sbf2E9PXF8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Sbf2E9PXF8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Sbf2E9PXF8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Sbf2E9PXF8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Sbf2E9PXF8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sbf2E9PXF8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Sbf2E9PXF8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Sbf2E9PXF8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sbf2E9PXF8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sbf2E9PXF8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Sbf2E9PXF8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Sbf2E9PXF8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sbf2E9PXF8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sbf2E9PXF8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Sbf2E9PXF8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,95■■■□□ 2,54
Sbf2E9PXF8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sbf2E9PXF8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Sbf2E9PXF8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Sbf2E9PXF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Sbf2E9PXF8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Sbf2E9PXF8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Sbf2E9PXF8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sbf2E9PXF8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sbf2E9PXF8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sbf2E9PXF8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sbf2E9PXF8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Sbf2E9PXF8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Sbf2E9PXF8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Sbf2E9PXF8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Sbf2E9PXF8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sbf2E9PXF8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sbf2E9PXF8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Sbf2E9PXF8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sbf2E9PXF8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sbf2E9PXF8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sbf2E9PXF8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sbf2E9PXF8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Sbf2E9PXF8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sbf2E9PXF8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sbf2E9PXF8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sbf2E9PXF8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sbf2E9PXF8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Sbf2E9PXF8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sbf2E9PXF8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sbf2E9PXF8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sbf2E9PXF8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Sbf2E9PXF8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Sbf2E9PXF8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Sbf2E9PXF8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sbf2E9PXF8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Sbf2E9PXF8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Sbf2E9PXF8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,44
Sbf2E9PXF8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sbf2E9PXF8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sbf2E9PXF8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sbf2E9PXF8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sbf2E9PXF8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Sbf2E9PXF8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Sbf2E9PXF8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms