Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Scgb1b20E9PWZ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Scgb1b20E9PWZ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Scgb1b20E9PWZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Scgb1b20E9PWZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Scgb1b20E9PWZ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Scgb1b20E9PWZ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Scgb1b20E9PWZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Scgb1b20E9PWZ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Scgb1b20E9PWZ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Scgb1b20E9PWZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Scgb1b20E9PWZ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Scgb1b20E9PWZ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Scgb1b20E9PWZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Scgb1b20E9PWZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Scgb1b20E9PWZ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Scgb1b20E9PWZ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Scgb1b20E9PWZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Scgb1b20E9PWZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Scgb1b20E9PWZ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Scgb1b20E9PWZ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Scgb1b20E9PWZ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Scgb1b20E9PWZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Scgb1b20E9PWZ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,31■■□□□ 1
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Scgb1b20E9PWZ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,29■■□□□ 1
Scgb1b20E9PWZ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Scgb1b20E9PWZ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Scgb1b20E9PWZ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Scgb1b20E9PWZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Scgb1b20E9PWZ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Scgb1b20E9PWZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Scgb1b20E9PWZ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Scgb1b20E9PWZ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Scgb1b20E9PWZ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Scgb1b20E9PWZ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Scgb1b20E9PWZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Scgb1b20E9PWZ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Scgb1b20E9PWZ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,96■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Scgb1b20E9PWZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Scgb1b20E9PWZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Scgb1b20E9PWZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Scgb1b20E9PWZ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Scgb1b20E9PWZ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Scgb1b20E9PWZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Scgb1b20E9PWZ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Scgb1b20E9PWZ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Scgb1b20E9PWZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms