Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PtpruB1AUH1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PtpruB1AUH1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PtpruB1AUH1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PtpruB1AUH1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtpruB1AUH1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PtpruB1AUH1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PtpruB1AUH1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PtpruB1AUH1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PtpruB1AUH1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PtpruB1AUH1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PtpruB1AUH1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PtpruB1AUH1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PtpruB1AUH1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PtpruB1AUH1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PtpruB1AUH1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PtpruB1AUH1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PtpruB1AUH1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PtpruB1AUH1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PtpruB1AUH1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PtpruB1AUH1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PtpruB1AUH1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PtpruB1AUH1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PtpruB1AUH1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtpruB1AUH1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
PtpruB1AUH1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PtpruB1AUH1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PtpruB1AUH1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PtpruB1AUH1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PtpruB1AUH1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtpruB1AUH1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PtpruB1AUH1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtpruB1AUH1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtpruB1AUH1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtpruB1AUH1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PtpruB1AUH1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PtpruB1AUH1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PtpruB1AUH1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtpruB1AUH1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PtpruB1AUH1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PtpruB1AUH1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PtpruB1AUH1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PtpruB1AUH1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtpruB1AUH1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PtpruB1AUH1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PtpruB1AUH1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PtpruB1AUH1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PtpruB1AUH1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PtpruB1AUH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtpruB1AUH1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtpruB1AUH1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PtpruB1AUH1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PtpruB1AUH1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtpruB1AUH1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtpruB1AUH1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtpruB1AUH1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PtpruB1AUH1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PtpruB1AUH1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PtpruB1AUH1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PtpruB1AUH1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtpruB1AUH1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PtpruB1AUH1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PtpruB1AUH1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PtpruB1AUH1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PtpruB1AUH1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PtpruB1AUH1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PtpruB1AUH1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PtpruB1AUH1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PtpruB1AUH1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PtpruB1AUH1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PtpruB1AUH1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PtpruB1AUH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PtpruB1AUH1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtpruB1AUH1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtpruB1AUH1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PtpruB1AUH1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtpruB1AUH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtpruB1AUH1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PtpruB1AUH1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtpruB1AUH1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PtpruB1AUH1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtpruB1AUH1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtpruB1AUH1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PtpruB1AUH1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PtpruB1AUH1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtpruB1AUH1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtpruB1AUH1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PtpruB1AUH1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtpruB1AUH1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PtpruB1AUH1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtpruB1AUH1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtpruB1AUH1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
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