Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmcn2A2AJ76 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmcn2A2AJ76 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmcn2A2AJ76 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmcn2A2AJ76 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmcn2A2AJ76 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmcn2A2AJ76 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmcn2A2AJ76 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmcn2A2AJ76 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmcn2A2AJ76 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmcn2A2AJ76 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmcn2A2AJ76 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmcn2A2AJ76 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmcn2A2AJ76 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmcn2A2AJ76 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmcn2A2AJ76 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmcn2A2AJ76 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmcn2A2AJ76 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmcn2A2AJ76 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmcn2A2AJ76 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmcn2A2AJ76 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmcn2A2AJ76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmcn2A2AJ76 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmcn2A2AJ76 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmcn2A2AJ76 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmcn2A2AJ76 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmcn2A2AJ76 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmcn2A2AJ76 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmcn2A2AJ76 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmcn2A2AJ76 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmcn2A2AJ76 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmcn2A2AJ76 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmcn2A2AJ76 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmcn2A2AJ76 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmcn2A2AJ76 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmcn2A2AJ76 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmcn2A2AJ76 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmcn2A2AJ76 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmcn2A2AJ76 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmcn2A2AJ76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmcn2A2AJ76 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmcn2A2AJ76 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmcn2A2AJ76 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmcn2A2AJ76 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmcn2A2AJ76 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmcn2A2AJ76 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmcn2A2AJ76 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmcn2A2AJ76 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmcn2A2AJ76 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmcn2A2AJ76 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmcn2A2AJ76 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmcn2A2AJ76 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmcn2A2AJ76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmcn2A2AJ76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmcn2A2AJ76 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms